गुजरात और राजस्थान के मंत्रियों और पुलिस अधिकारियों सहित 38 आरोपियों के खिलाफ आपराधिक कार्यवाही शुरू हुई, 2005 में सोहराबुद्दीन शेख, उनकी पत्नी कौसरबी और 2006 में उनके सहयोगी तुलसीराम प्रजापति के कथित फर्जी मुठभेड़ों में, अंततः केवल 22 आरोपियों पर मुकदमा चल रहा है।
सुप्रीम कोर्ट के आदेश के बाद 2010 में गुजरात सीआईडी से जांच संभालने वाली सीबीआई ने 38 आरोपियों का नाम दिया था, जिसमें गुजरात एमओएस (होम) अमित शाह, राजस्थान के गृहमंत्री गुलाब चंद कटारिया और वरिष्ठ आईपीएस अधिकारी शामिल थे।
हालांकि, 2014 और 2017 के बीच, सुनवाई अदालत ने विपुल अग्रवाल को छोड़कर शाह, कटारिया और सभी आईपीएस अधिकारियों सहित 15 आरोपियों को बरी कर दिया। हालांकि कुछ सबूतों की कमी के कारण छुट्टी दी गई थी, लेकिन मुकदमे की अदालत ने मुकदमा चलाने के लिए मंजूरी की कमी के लिए कुछ के खिलाफ आरोप भी घटा दिए थे।
सोमवार को, जैसा कि बॉम्बे हाईकोर्ट ने अग्रवाल को छुट्टी दी थी, जिनकी याचिका सुनवाई अदालत ने दो बार खारिज कर दी थी, सीबीआई द्वारा आरोपी के रूप में नामित 38 में से 16 को इस मामले में मुकदमे का सामना नहीं करना पड़ेगा।
वर्तमान में 22 लोग परीक्षणों में राजस्थान, गुजरात और आंध्र प्रदेश के निरीक्षक, सहायक निरीक्षक, उप-निरीक्षक और कांस्टेबल शामिल हैं। वे षड्यंत्र के आरोपों का सामना कर रहे हैं।
2010 में, जब सीबीआई ने मामले की जांच शुरू की, तो उसने दावा किया था कि 2005 में सोहराबुद्दीन, एक वांछित अपराधी, राजस्थान के उदयपुर में संगमरमर व्यापारियों को निकालने में शामिल था। इसमें कहा गया है कि व्यापारियों ने राजस्थान और गुजरात के कुछ राजनीतिक नेताओं और पुलिस अधिकारियों से संपर्क किया, जो सोहराबुद्दीन को खत्म करने के लिए आपराधिक षड्यंत्र में शामिल हुए।
सीबीआई ने अदालत से गुजरात से मामले को स्थानांतरित करने का आग्रह करने के बाद सुप्रीम कोर्ट के आदेश के बाद 2012 में अहमदाबाद से मुंबई में मुकदमा चलाया था। तब से, चार न्यायाधीशों ने इस मामले को सुना था।